Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL35Q6PF15 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.33■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL35Q6PF15 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms