Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA3EQ6PEY2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA3EQ6PEY2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA3EQ6PEY2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA3EQ6PEY2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA3EQ6PEY2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA3EQ6PEY2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA3EQ6PEY2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA3EQ6PEY2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA3EQ6PEY2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA3EQ6PEY2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA3EQ6PEY2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA3EQ6PEY2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA3EQ6PEY2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA3EQ6PEY2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA3EQ6PEY2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA3EQ6PEY2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA3EQ6PEY2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA3EQ6PEY2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA3EQ6PEY2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA3EQ6PEY2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA3EQ6PEY2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA3EQ6PEY2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA3EQ6PEY2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA3EQ6PEY2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBA3EQ6PEY2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBA3EQ6PEY2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBA3EQ6PEY2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBA3EQ6PEY2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBA3EQ6PEY2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms