Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6P435 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q6P435 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6P435 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6P435 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6P435 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6P435 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6P435 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6P435 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6P435 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6P435 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6P435 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6P435 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6P435 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6P435 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6P435 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6P435 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q6P435 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q6P435 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q6P435 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q6P435 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Q6P435 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q6P435 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Q6P435 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q6P435 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q6P435 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q6P435 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q6P435 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q6P435 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q6P435 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q6P435 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q6P435 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q6P435 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q6P435 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q6P435 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q6P435 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q6P435 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q6P435 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q6P435 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q6P435 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Q6P435 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q6P435 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Q6P435 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q6P435 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q6P435 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Q6P435 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q6P435 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q6P435 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q6P435 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q6P435 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q6P435 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q6P435 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q6P435 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q6P435 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q6P435 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q6P435 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q6P435 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q6P435 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q6P435 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q6P435 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q6P435 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q6P435 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Q6P435 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Q6P435 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q6P435 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q6P435 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q6P435 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q6P435 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Q6P435 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q6P435 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q6P435 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q6P435 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q6P435 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q6P435 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q6P435 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q6P435 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q6P435 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q6P435 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q6P435 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q6P435 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q6P435 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q6P435 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q6P435 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q6P435 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q6P435 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q6P435 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q6P435 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q6P435 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Q6P435 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Q6P435 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Q6P435 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q6P435 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q6P435 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q6P435 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q6P435 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q6P435 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q6P435 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q6P435 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q6P435 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q6P435 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms