Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 CWF19L1-206ENST00000478047 2694 ntTSL 27.01□□□□□ -1.294e-12■■■■■ 45.5
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PRPF8Q6P2Q9 TAF1B-205ENST00000434858 1592 ntTSL 26.9□□□□□ -1.32e-13■■■■■ 45.5
PRPF8Q6P2Q9 NFRKB-208ENST00000531318 564 ntTSL 46.81□□□□□ -1.324e-12■■■■■ 45.5
PRPF8Q6P2Q9 FANCD2-207ENST00000438741 558 ntTSL 26.7□□□□□ -1.344e-12■■■■■ 45.5
PRPF8Q6P2Q9 TTC23-202ENST00000394129 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.344e-12■■■■■ 45.5
PRPF8Q6P2Q9 PROSER1-205ENST00000484434 2150 ntTSL 26.64□□□□□ -1.354e-12■■■■■ 45.5
PRPF8Q6P2Q9 ANKRD36C-204ENST00000528268 1907 ntTSL 26.33□□□□□ -1.44e-12■■■■■ 45.5
PRPF8Q6P2Q9 CWF19L1-201ENST00000354105 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.434e-12■■■■■ 45.5
PRPF8Q6P2Q9 CCNB2-205ENST00000621385 2503 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.454e-12■■■■■ 45.5
PRPF8Q6P2Q9 SENP5-206ENST00000463245 765 ntTSL 26□□□□□ -1.454e-12■■■■■ 45.5
PRPF8Q6P2Q9 KANSL2-205ENST00000547582 581 ntTSL 55.61□□□□□ -1.512e-7■■■■■ 45.5
PRPF8Q6P2Q9 B4GALT4-214ENST00000479308 452 ntTSL 35.48□□□□□ -1.534e-12■■■■■ 45.5
PRPF8Q6P2Q9 PMS2P3-203ENST00000422064 567 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.544e-12■■■■■ 45.5
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PRPF8Q6P2Q9 UBE3C-206ENST00000474153 450 ntTSL 25.2□□□□□ -1.581e-8■■■■■ 45.5
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PRPF8Q6P2Q9 DCBLD2-207ENST00000479144 692 ntTSL 24.94□□□□□ -1.624e-12■■■■■ 45.5
PRPF8Q6P2Q9 PMS2P3-206ENST00000438326 229 ntTSL 54.69□□□□□ -1.664e-12■■■■■ 45.5
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PRPF8Q6P2Q9 DCBLD2-209ENST00000494614 727 ntTSL 33.86□□□□□ -1.794e-12■■■■■ 45.5
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PRPF8Q6P2Q9 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.872e-8■■■■■ 45.5
PRPF8Q6P2Q9 CWF19L1-205ENST00000473842 654 ntTSL 53.11□□□□□ -1.914e-12■■■■■ 45.5
PRPF8Q6P2Q9 CWF19L1-208ENST00000496796 727 ntTSL 32.97□□□□□ -1.934e-12■■■■■ 45.5
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PRPF8Q6P2Q9 SMC6-202ENST00000381272 1803 ntTSL 52.7□□□□□ -1.984e-12■■■■■ 45.5
PRPF8Q6P2Q9 OSBPL8-204ENST00000546946 2698 ntTSL 22.52□□□□□ -2.011e-9■■■■■ 45.5
PRPF8Q6P2Q9 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.034e-12■■■■■ 45.5
PRPF8Q6P2Q9 CWF19L1-203ENST00000466955 659 ntTSL 32.09□□□□□ -2.074e-12■■■■■ 45.5
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PRPF8Q6P2Q9 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.194e-12■■■■■ 45.5
PRPF8Q6P2Q9 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.334e-12■■■■■ 45.5
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PRPF8Q6P2Q9 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC-0.22□□□□□ -2.444e-12■■■■■ 45.5
PRPF8Q6P2Q9 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.464e-12■■■■■ 45.5
PRPF8Q6P2Q9 PROSER1-208ENST00000602512 569 ntTSL 2-0.95□□□□□ -2.564e-12■■■■■ 45.5
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PRPF8Q6P2Q9 GRB14-205ENST00000488342 1983 ntTSL 517.01■□□□□ 0.318e-15■■■■■ 45.4
PRPF8Q6P2Q9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.038e-15■■■■■ 45.4
PRPF8Q6P2Q9 GRB14-203ENST00000446413 1435 ntTSL 1 (best)14.29□□□□□ -0.128e-15■■■■■ 45.4
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PRPF8Q6P2Q9 PICK1-210ENST00000468288 569 ntTSL 412.45□□□□□ -0.424e-7■■■■■ 45.4
PRPF8Q6P2Q9 PICK1-205ENST00000432756 582 ntTSL 57.64□□□□□ -1.194e-7■■■■■ 45.4
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PRPF8Q6P2Q9 CHPT1-208ENST00000552215 4342 ntTSL 1 (best)7.33□□□□□ -1.243e-11■■■■■ 45.3
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PRPF8Q6P2Q9 AMDHD2-214ENST00000567475 714 ntTSL 217.56■□□□□ 0.41e-8■■■■■ 45.3
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PRPF8Q6P2Q9 SESTD1-204ENST00000435047 681 ntTSL 310.62□□□□□ -0.715e-11■■■■■ 45.3
PRPF8Q6P2Q9 SESTD1-208ENST00000486468 423 ntTSL 23.61□□□□□ -1.835e-11■■■■■ 45.3
PRPF8Q6P2Q9 SESTD1-205ENST00000440010 619 ntTSL 31.45□□□□□ -2.185e-11■■■■■ 45.3
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PRPF8Q6P2Q9 NDUFA10-209ENST00000448880 434 ntTSL 52.02□□□□□ -2.095e-8■■■■■ 45.2
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PRPF8Q6P2Q9 EXOC5-206ENST00000555148 2349 ntTSL 213.56□□□□□ -0.244e-8■■■■■ 45.2
PRPF8Q6P2Q9 RARS-208ENST00000522834 559 ntTSL 512.51□□□□□ -0.413e-13■■■■■ 45.2
PRPF8Q6P2Q9 RARS-207ENST00000521939 678 ntTSL 211.34□□□□□ -0.593e-13■■■■■ 45.2
PRPF8Q6P2Q9 EXOC5-202ENST00000413566 8513 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.744e-8■■■■■ 45.2
PRPF8Q6P2Q9 EXOC5-211ENST00000621441 10589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.914e-8■■■■■ 45.2
PRPF8Q6P2Q9 RARS-203ENST00000519346 945 ntTSL 34.38□□□□□ -1.713e-13■■■■■ 45.2
PRPF8Q6P2Q9 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.934e-8■■■■■ 45.2
PRPF8Q6P2Q9 TACC1-203ENST00000517336 293 ntTSL 35.48□□□□□ -1.532e-10■■■■■ 45.2
PRPF8Q6P2Q9 MARK3-212ENST00000558223 908 ntTSL 1 (best)5.26□□□□□ -1.578e-14■■■■■ 45.2
PRPF8Q6P2Q9 BCR-203ENST00000419722 788 ntTSL 511.04□□□□□ -0.641e-10■■■■■ 45.2
PRPF8Q6P2Q9 TARDBP-221ENST00000619555 682 ntTSL 59.82□□□□□ -0.848e-12■■■■■ 45.2
PRPF8Q6P2Q9 TARDBP-223ENST00000620632 706 ntTSL 39.11□□□□□ -0.958e-12■■■■■ 45.2
PRPF8Q6P2Q9 TARDBP-211ENST00000610369 563 ntTSL 58.23□□□□□ -1.098e-12■■■■■ 45.2
PRPF8Q6P2Q9 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.038e-8■■■■■ 45.1
PRPF8Q6P2Q9 SASH1-204ENST00000622663 5075 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.138e-8■■■■■ 45.1
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