Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGMBQ6NW40 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGMBQ6NW40 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RGMBQ6NW40 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGMBQ6NW40 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGMBQ6NW40 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGMBQ6NW40 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGMBQ6NW40 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGMBQ6NW40 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGMBQ6NW40 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGMBQ6NW40 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGMBQ6NW40 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGMBQ6NW40 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGMBQ6NW40 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGMBQ6NW40 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGMBQ6NW40 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGMBQ6NW40 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RGMBQ6NW40 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGMBQ6NW40 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGMBQ6NW40 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGMBQ6NW40 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
RGMBQ6NW40 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RGMBQ6NW40 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RGMBQ6NW40 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms