Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH7

SWSAP1, ATPase SWSAP1, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWSAP1Q6NVH7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SWSAP1Q6NVH7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SWSAP1Q6NVH7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms