Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTE8

MRNIP, MRN complex-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRNIPQ6NTE8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
MRNIPQ6NTE8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRNIPQ6NTE8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms