Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC70Q6NSX1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC70Q6NSX1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC70Q6NSX1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms