Protein–RNA interactions for Protein: Q6GYQ0

RALGAPA1, Ral GTPase-activating protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 2,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPA1Q6GYQ0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RALGAPA1Q6GYQ0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RALGAPA1Q6GYQ0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms