Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SUMO4Q6EEV6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SUMO4Q6EEV6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SUMO4Q6EEV6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SUMO4Q6EEV6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SUMO4Q6EEV6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SUMO4Q6EEV6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SUMO4Q6EEV6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SUMO4Q6EEV6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SUMO4Q6EEV6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SUMO4Q6EEV6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SUMO4Q6EEV6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SUMO4Q6EEV6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SUMO4Q6EEV6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SUMO4Q6EEV6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SUMO4Q6EEV6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SUMO4Q6EEV6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SUMO4Q6EEV6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms