Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZY7

SCARA3, Scavenger receptor class A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA3Q6AZY7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCARA3Q6AZY7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCARA3Q6AZY7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms