Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DUPD1Q68J44 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUPD1Q68J44 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms