Protein–RNA interactions for Protein: Q659A1

ICE2, Little elongation complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ICE2Q659A1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ICE2Q659A1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ICE2Q659A1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ICE2Q659A1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ICE2Q659A1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ICE2Q659A1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ICE2Q659A1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ICE2Q659A1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ICE2Q659A1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ICE2Q659A1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ICE2Q659A1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ICE2Q659A1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ICE2Q659A1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ICE2Q659A1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ICE2Q659A1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ICE2Q659A1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ICE2Q659A1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ICE2Q659A1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ICE2Q659A1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ICE2Q659A1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms