Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CARMIL1Q5VZK9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
CARMIL1Q5VZK9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CARMIL1Q5VZK9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CARMIL1Q5VZK9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CARMIL1Q5VZK9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CARMIL1Q5VZK9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CARMIL1Q5VZK9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CARMIL1Q5VZK9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CARMIL1Q5VZK9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CARMIL1Q5VZK9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CARMIL1Q5VZK9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CARMIL1Q5VZK9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
CARMIL1Q5VZK9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CARMIL1Q5VZK9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CARMIL1Q5VZK9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CARMIL1Q5VZK9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CARMIL1Q5VZK9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CARMIL1Q5VZK9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
CARMIL1Q5VZK9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CARMIL1Q5VZK9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CARMIL1Q5VZK9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CARMIL1Q5VZK9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CARMIL1Q5VZK9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CARMIL1Q5VZK9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CARMIL1Q5VZK9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CARMIL1Q5VZK9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CARMIL1Q5VZK9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
CARMIL1Q5VZK9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CARMIL1Q5VZK9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CARMIL1Q5VZK9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CARMIL1Q5VZK9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
CARMIL1Q5VZK9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
CARMIL1Q5VZK9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CARMIL1Q5VZK9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CARMIL1Q5VZK9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CARMIL1Q5VZK9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CARMIL1Q5VZK9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CARMIL1Q5VZK9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CARMIL1Q5VZK9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CARMIL1Q5VZK9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CARMIL1Q5VZK9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CARMIL1Q5VZK9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms