Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYJ5

MALRD1, MAM and LDL-receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALRD1Q5VYJ5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MALRD1Q5VYJ5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MALRD1Q5VYJ5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MALRD1Q5VYJ5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MALRD1Q5VYJ5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MALRD1Q5VYJ5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MALRD1Q5VYJ5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MALRD1Q5VYJ5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MALRD1Q5VYJ5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MALRD1Q5VYJ5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MALRD1Q5VYJ5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MALRD1Q5VYJ5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MALRD1Q5VYJ5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MALRD1Q5VYJ5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MALRD1Q5VYJ5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MALRD1Q5VYJ5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MALRD1Q5VYJ5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MALRD1Q5VYJ5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MALRD1Q5VYJ5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MALRD1Q5VYJ5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MALRD1Q5VYJ5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MALRD1Q5VYJ5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MALRD1Q5VYJ5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MALRD1Q5VYJ5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MALRD1Q5VYJ5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MALRD1Q5VYJ5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms