Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LGSNQ5TDP6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LGSNQ5TDP6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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