Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
RSPH4AQ5TD94 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
RSPH4AQ5TD94 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
RSPH4AQ5TD94 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
RSPH4AQ5TD94 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
RSPH4AQ5TD94 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
RSPH4AQ5TD94 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC32.87■■■□□ 2.85
RSPH4AQ5TD94 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
RSPH4AQ5TD94 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RSPH4AQ5TD94 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RSPH4AQ5TD94 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RSPH4AQ5TD94 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
RSPH4AQ5TD94 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RSPH4AQ5TD94 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
RSPH4AQ5TD94 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
RSPH4AQ5TD94 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
RSPH4AQ5TD94 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
RSPH4AQ5TD94 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RSPH4AQ5TD94 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
RSPH4AQ5TD94 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
RSPH4AQ5TD94 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RSPH4AQ5TD94 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
RSPH4AQ5TD94 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
RSPH4AQ5TD94 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
RSPH4AQ5TD94 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
RSPH4AQ5TD94 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
RSPH4AQ5TD94 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
RSPH4AQ5TD94 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
RSPH4AQ5TD94 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
RSPH4AQ5TD94 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
RSPH4AQ5TD94 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
RSPH4AQ5TD94 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
RSPH4AQ5TD94 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
RSPH4AQ5TD94 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
RSPH4AQ5TD94 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
RSPH4AQ5TD94 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
RSPH4AQ5TD94 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
RSPH4AQ5TD94 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
RSPH4AQ5TD94 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
RSPH4AQ5TD94 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
RSPH4AQ5TD94 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
RSPH4AQ5TD94 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
RSPH4AQ5TD94 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
RSPH4AQ5TD94 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
RSPH4AQ5TD94 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
RSPH4AQ5TD94 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
RSPH4AQ5TD94 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
RSPH4AQ5TD94 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
RSPH4AQ5TD94 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
RSPH4AQ5TD94 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
RSPH4AQ5TD94 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
RSPH4AQ5TD94 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
RSPH4AQ5TD94 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
RSPH4AQ5TD94 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
RSPH4AQ5TD94 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
RSPH4AQ5TD94 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
RSPH4AQ5TD94 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RSPH4AQ5TD94 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RSPH4AQ5TD94 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RSPH4AQ5TD94 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RSPH4AQ5TD94 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC32.8■■■□□ 2.84
RSPH4AQ5TD94 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
RSPH4AQ5TD94 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
RSPH4AQ5TD94 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
RSPH4AQ5TD94 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RSPH4AQ5TD94 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RSPH4AQ5TD94 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
RSPH4AQ5TD94 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
RSPH4AQ5TD94 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
RSPH4AQ5TD94 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
RSPH4AQ5TD94 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RSPH4AQ5TD94 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
RSPH4AQ5TD94 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RSPH4AQ5TD94 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RSPH4AQ5TD94 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RSPH4AQ5TD94 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RSPH4AQ5TD94 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
RSPH4AQ5TD94 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RSPH4AQ5TD94 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
RSPH4AQ5TD94 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
RSPH4AQ5TD94 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
RSPH4AQ5TD94 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RSPH4AQ5TD94 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RSPH4AQ5TD94 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
RSPH4AQ5TD94 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
RSPH4AQ5TD94 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RSPH4AQ5TD94 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RSPH4AQ5TD94 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RSPH4AQ5TD94 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RSPH4AQ5TD94 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
RSPH4AQ5TD94 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.84
RSPH4AQ5TD94 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
RSPH4AQ5TD94 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms