Protein–RNA interactions for Protein: Q5T870

PRR9, Proline-rich protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR9Q5T870 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRR9Q5T870 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRR9Q5T870 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms