Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC183Q5T5S1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC183Q5T5S1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC183Q5T5S1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms