Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1orf220Q5T0J3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf220Q5T0J3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf220Q5T0J3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms