Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNT1Q5JUK3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms