Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF628Q5EBL2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF628Q5EBL2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF628Q5EBL2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF628Q5EBL2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF628Q5EBL2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms