Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ODF2Q5BJF6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ODF2Q5BJF6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms