Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC178Q5BJE1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC178Q5BJE1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC178Q5BJE1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms