Protein–RNA interactions for Protein: Q58FG1

HSP90AA4P, Putative heat shock protein HSP 90-alpha A4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AA4PQ58FG1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HSP90AA4PQ58FG1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HSP90AA4PQ58FG1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HSP90AA4PQ58FG1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HSP90AA4PQ58FG1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HSP90AA4PQ58FG1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HSP90AA4PQ58FG1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSP90AA4PQ58FG1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSP90AA4PQ58FG1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSP90AA4PQ58FG1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSP90AA4PQ58FG1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSP90AA4PQ58FG1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSP90AA4PQ58FG1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSP90AA4PQ58FG1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSP90AA4PQ58FG1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSP90AA4PQ58FG1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSP90AA4PQ58FG1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HSP90AA4PQ58FG1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HSP90AA4PQ58FG1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HSP90AA4PQ58FG1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HSP90AA4PQ58FG1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HSP90AA4PQ58FG1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HSP90AA4PQ58FG1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HSP90AA4PQ58FG1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HSP90AA4PQ58FG1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HSP90AA4PQ58FG1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HSP90AA4PQ58FG1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HSP90AA4PQ58FG1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HSP90AA4PQ58FG1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HSP90AA4PQ58FG1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HSP90AA4PQ58FG1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HSP90AA4PQ58FG1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HSP90AA4PQ58FG1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HSP90AA4PQ58FG1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HSP90AA4PQ58FG1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HSP90AA4PQ58FG1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HSP90AA4PQ58FG1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HSP90AA4PQ58FG1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HSP90AA4PQ58FG1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HSP90AA4PQ58FG1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HSP90AA4PQ58FG1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms