Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL22Q53GT1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL22Q53GT1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms