Protein–RNA interactions for Protein: Q53GI3

ZNF394, Zinc finger protein 394, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF394Q53GI3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF394Q53GI3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF394Q53GI3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms