Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PKDCCQ504Y2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PKDCCQ504Y2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKDCCQ504Y2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKDCCQ504Y2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKDCCQ504Y2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKDCCQ504Y2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKDCCQ504Y2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PKDCCQ504Y2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKDCCQ504Y2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKDCCQ504Y2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKDCCQ504Y2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKDCCQ504Y2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKDCCQ504Y2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKDCCQ504Y2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKDCCQ504Y2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKDCCQ504Y2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKDCCQ504Y2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms