Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DUSP28Q4G0W2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DUSP28Q4G0W2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms