Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPK5

CTU2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2Q2VPK5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTU2Q2VPK5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTU2Q2VPK5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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