Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SGSM1Q2NKQ1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGSM1Q2NKQ1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
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