Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC142Q17RM4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC142Q17RM4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
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