Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDO1Q16878 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDO1Q16878 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
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