Protein–RNA interactions for Protein: Q16594

TAF9, Transcription initiation factor TFIID subunit 9, humanhuman

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF9Q16594 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TAF9Q16594 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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