Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAMA4Q16363 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMA4Q16363 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms