Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDCD2Q16342 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCD2Q16342 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDCD2Q16342 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDCD2Q16342 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDCD2Q16342 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDCD2Q16342 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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