Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SNCBQ16143 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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SNCBQ16143 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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SNCBQ16143 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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SNCBQ16143 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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SNCBQ16143 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNCBQ16143 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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