Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NCOA1Q15788 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NCOA1Q15788 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NCOA1Q15788 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NCOA1Q15788 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NCOA1Q15788 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NCOA1Q15788 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NCOA1Q15788 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NCOA1Q15788 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NCOA1Q15788 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NCOA1Q15788 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NCOA1Q15788 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NCOA1Q15788 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NCOA1Q15788 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NCOA1Q15788 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NCOA1Q15788 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NCOA1Q15788 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NCOA1Q15788 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NCOA1Q15788 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NCOA1Q15788 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NCOA1Q15788 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NCOA1Q15788 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NCOA1Q15788 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
NCOA1Q15788 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NCOA1Q15788 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NCOA1Q15788 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NCOA1Q15788 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NCOA1Q15788 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NCOA1Q15788 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NCOA1Q15788 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NCOA1Q15788 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NCOA1Q15788 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NCOA1Q15788 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
NCOA1Q15788 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NCOA1Q15788 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
NCOA1Q15788 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
NCOA1Q15788 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
NCOA1Q15788 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
NCOA1Q15788 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
NCOA1Q15788 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
NCOA1Q15788 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
NCOA1Q15788 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
NCOA1Q15788 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
NCOA1Q15788 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NCOA1Q15788 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NCOA1Q15788 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NCOA1Q15788 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NCOA1Q15788 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NCOA1Q15788 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NCOA1Q15788 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NCOA1Q15788 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NCOA1Q15788 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NCOA1Q15788 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NCOA1Q15788 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NCOA1Q15788 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NCOA1Q15788 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NCOA1Q15788 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
NCOA1Q15788 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NCOA1Q15788 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NCOA1Q15788 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NCOA1Q15788 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NCOA1Q15788 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NCOA1Q15788 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NCOA1Q15788 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NCOA1Q15788 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NCOA1Q15788 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NCOA1Q15788 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NCOA1Q15788 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NCOA1Q15788 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NCOA1Q15788 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NCOA1Q15788 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NCOA1Q15788 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NCOA1Q15788 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NCOA1Q15788 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NCOA1Q15788 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NCOA1Q15788 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NCOA1Q15788 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NCOA1Q15788 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NCOA1Q15788 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NCOA1Q15788 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NCOA1Q15788 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
NCOA1Q15788 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NCOA1Q15788 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
NCOA1Q15788 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
NCOA1Q15788 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NCOA1Q15788 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NCOA1Q15788 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NCOA1Q15788 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NCOA1Q15788 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NCOA1Q15788 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NCOA1Q15788 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
NCOA1Q15788 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
NCOA1Q15788 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
NCOA1Q15788 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
NCOA1Q15788 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
NCOA1Q15788 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
NCOA1Q15788 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
NCOA1Q15788 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
NCOA1Q15788 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
NCOA1Q15788 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
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