Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALX1Q15699 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ALX1Q15699 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALX1Q15699 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
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