Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRADDQ15628 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRADDQ15628 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
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