Protein–RNA interactions for Protein: Q15527

SURF2, Surfeit locus protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF2Q15527 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SURF2Q15527 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SURF2Q15527 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms