Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CYTH1Q15438 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYTH1Q15438 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms