Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYCP1Q15431 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCP1Q15431 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYCP1Q15431 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms