Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NKX1-1Q15270 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NKX1-1Q15270 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NKX1-1Q15270 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NKX1-1Q15270 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NKX1-1Q15270 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NKX1-1Q15270 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NKX1-1Q15270 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NKX1-1Q15270 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NKX1-1Q15270 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NKX1-1Q15270 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NKX1-1Q15270 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NKX1-1Q15270 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NKX1-1Q15270 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NKX1-1Q15270 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NKX1-1Q15270 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NKX1-1Q15270 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NKX1-1Q15270 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NKX1-1Q15270 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NKX1-1Q15270 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NKX1-1Q15270 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NKX1-1Q15270 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NKX1-1Q15270 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
NKX1-1Q15270 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NKX1-1Q15270 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
NKX1-1Q15270 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NKX1-1Q15270 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms