Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDCD1Q15116 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCD1Q15116 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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