Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -01e-7■■■■■ 45.2
EFTUD2Q15029 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.021e-7■■■■■ 45.2
EFTUD2Q15029 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.031e-7■■■■■ 45.2
EFTUD2Q15029 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.091e-7■■■■■ 45.2
EFTUD2Q15029 ARHGAP45-209ENST00000587602 3875 ntTSL 214.09□□□□□ -0.151e-7■■■■■ 45.2
EFTUD2Q15029 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.211e-7■■■■■ 45.2
EFTUD2Q15029 LASP1-208ENST00000584106 1167 ntTSL 212.47□□□□□ -0.412e-6■■■■■ 45.2
EFTUD2Q15029 LASP1-204ENST00000435347 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.552e-6■■■■■ 45.2
EFTUD2Q15029 LASP1-203ENST00000433206 4023 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.562e-6■■■■■ 45.2
EFTUD2Q15029 LASP1-201ENST00000318008 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.672e-6■■■■■ 45.2
EFTUD2Q15029 NACA-210ENST00000548386 644 ntTSL 23.71□□□□□ -1.828e-8■■■■■ 45.1
EFTUD2Q15029 NACA-205ENST00000546410 600 ntTSL 23.38□□□□□ -1.878e-8■■■■■ 45.1
EFTUD2Q15029 DCXR-208ENST00000579004 341 ntTSL 311.96□□□□□ -0.493e-11■■■■■ 45.1
EFTUD2Q15029 LZTR1-211ENST00000479606 3442 ntTSL 213.86□□□□□ -0.193e-7■■■■■ 45.1
EFTUD2Q15029 ILF3-220ENST00000590869 531 ntTSL 512.02□□□□□ -0.491e-8■■■■■ 45.1
EFTUD2Q15029 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.951e-8■■■■■ 45.1
EFTUD2Q15029 PCBP4-208ENST00000471308 2087 ntTSL 217.62■□□□□ 0.411e-8■■■■■ 45.1
EFTUD2Q15029 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.271e-8■■■■■ 45.1
EFTUD2Q15029 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.171e-8■■■■■ 45.1
EFTUD2Q15029 TBL3-203ENST00000564171 917 ntTSL 220.72■□□□□ 0.918e-7■■■■■ 45.1
EFTUD2Q15029 LBR-203ENST00000421383 736 ntTSL 323.72■■□□□ 1.394e-8■■■■■ 45
EFTUD2Q15029 PHLDB1-204ENST00000524713 1591 ntTSL 521.91■■□□□ 1.14e-8■■■■■ 45
EFTUD2Q15029 PHLDB1-205ENST00000525226 1714 ntTSL 418.22■□□□□ 0.514e-8■■■■■ 45
EFTUD2Q15029 PHLDB1-216ENST00000529005 535 ntTSL 513.26□□□□□ -0.294e-8■■■■■ 45
EFTUD2Q15029 HDAC6-230ENST00000488543 2484 ntTSL 212.45□□□□□ -0.424e-8■■■■■ 45
EFTUD2Q15029 HDAC6-207ENST00000430858 618 ntTSL 39.32□□□□□ -0.924e-8■■■■■ 45
EFTUD2Q15029 SMCHD1-207ENST00000581711 546 ntTSL 43.68□□□□□ -1.824e-8■■■■■ 45
EFTUD2Q15029 ILKAP-209ENST00000490837 557 ntTSL 420.49■□□□□ 0.878e-7■■■■■ 45
EFTUD2Q15029 ILKAP-207ENST00000467133 618 ntTSL 418.38■□□□□ 0.538e-7■■■■■ 45
EFTUD2Q15029 ILKAP-203ENST00000457149 793 ntTSL 517.78■□□□□ 0.448e-7■■■■■ 45
EFTUD2Q15029 ILKAP-210ENST00000498727 587 ntTSL 216.92■□□□□ 0.38e-7■■■■■ 45
EFTUD2Q15029 ITPA-206ENST00000461029 378 ntTSL 514.03□□□□□ -0.167e-10■■■■■ 45
EFTUD2Q15029 AKR1A1-210ENST00000487654 552 ntTSL 25.96□□□□□ -1.463e-8■■■■■ 45
EFTUD2Q15029 FAM207A-204ENST00000479127 759 ntTSL 318.76■□□□□ 0.591e-6■■■■■ 45
EFTUD2Q15029 CC2D1B-208ENST00000485966 532 ntTSL 37.36□□□□□ -1.237e-7■■■■■ 44.9
EFTUD2Q15029 MSH5-211ENST00000463144 2296 ntTSL 510.54□□□□□ -0.723e-11■■■■■ 44.9
EFTUD2Q15029 MSH5-205ENST00000395853 2704 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.933e-11■■■■■ 44.9
EFTUD2Q15029 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.011e-7■■■■■ 44.9
EFTUD2Q15029 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.161e-7■■■■■ 44.9
EFTUD2Q15029 ZMYM3-209ENST00000489332 5723 ntTSL 512.05□□□□□ -0.481e-7■■■■■ 44.9
EFTUD2Q15029 ZMYM3-201ENST00000314425 5536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.671e-7■■■■■ 44.9
EFTUD2Q15029 ZMYM3-205ENST00000373984 5253 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.711e-7■■■■■ 44.9
EFTUD2Q15029 HJURP-203ENST00000414924 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 419.44■□□□□ 0.71e-6■■■■■ 44.9
EFTUD2Q15029 HJURP-208ENST00000453122 634 ntTSL 415.74■□□□□ 0.111e-6■■■■■ 44.9
EFTUD2Q15029 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.131e-6■■■■■ 44.9
EFTUD2Q15029 HJURP-204ENST00000432087 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.291e-6■■■■■ 44.9
EFTUD2Q15029 HJURP-202ENST00000411486 3187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.361e-6■■■■■ 44.9
EFTUD2Q15029 HJURP-209ENST00000454020 806 ntTSL 511.83□□□□□ -0.521e-6■■■■■ 44.9
EFTUD2Q15029 IPO4-212ENST00000560222 573 ntTSL 314.85□□□□□ -0.034e-11■■■■■ 44.9
EFTUD2Q15029 SSH3-208ENST00000532181 948 ntTSL 311.97□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 44.9
EFTUD2Q15029 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.165e-20■■■■■ 44.9
EFTUD2Q15029 AKAP9-216ENST00000619023 6006 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.55e-20■■■■■ 44.9
EFTUD2Q15029 AKAP9-214ENST00000493453 6020 ntTSL 29.37□□□□□ -0.915e-20■■■■■ 44.9
EFTUD2Q15029 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.555e-20■■■■■ 44.9
EFTUD2Q15029 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.945e-20■■■■■ 44.9
EFTUD2Q15029 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.975e-20■■■■■ 44.9
EFTUD2Q15029 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.391e-6■■■■■ 44.8
EFTUD2Q15029 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.211e-6■■■■■ 44.8
EFTUD2Q15029 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.051e-6■■■■■ 44.8
EFTUD2Q15029 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.141e-6■■■■■ 44.8
EFTUD2Q15029 DCXR-205ENST00000577996 98 ntTSL 3-1.39□□□□□ -2.631e-15■■■■■ 44.8
EFTUD2Q15029 LLGL2-208ENST00000578034 485 ntTSL 215.58■□□□□ 0.086e-7■■■■■ 44.8
EFTUD2Q15029 AL121845.2-202ENST00000476221 446 ntTSL 516.9■□□□□ 0.36e-9■■■■■ 44.8
EFTUD2Q15029 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.136e-9■■■■■ 44.8
EFTUD2Q15029 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.483e-8■■■■■ 44.8
EFTUD2Q15029 FTSJ1-206ENST00000473235 688 ntTSL 517.63■□□□□ 0.413e-8■■■■■ 44.8
EFTUD2Q15029 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.343e-8■■■■■ 44.8
EFTUD2Q15029 FTSJ1-212ENST00000492562 610 ntTSL 316.47■□□□□ 0.233e-8■■■■■ 44.8
EFTUD2Q15029 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.23e-8■■■■■ 44.8
EFTUD2Q15029 FAM207A-203ENST00000458015 643 ntTSL 519.16■□□□□ 0.661e-7■■■■■ 44.8
EFTUD2Q15029 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.223e-7■■■■■ 44.8
EFTUD2Q15029 EEF1A1-209ENST00000495333 958 ntTSL 56.07□□□□□ -1.443e-20■■■■■ 44.6
EFTUD2Q15029 B4GALT3-211ENST00000493164 807 ntTSL 215.07■□□□□ 03e-9■■■■■ 44.6
EFTUD2Q15029 B4GALT3-212ENST00000496313 909 ntTSL 214.68□□□□□ -0.063e-9■■■■■ 44.6
EFTUD2Q15029 EMG1-202ENST00000599672 4898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.423e-9■■■■■ 44.6
EFTUD2Q15029 EMG1-203ENST00000611981 1223 ntTSL 211.53□□□□□ -0.563e-9■■■■■ 44.6
EFTUD2Q15029 EMG1-206ENST00000607161 1087 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.593e-9■■■■■ 44.6
EFTUD2Q15029 EMG1-205ENST00000261406 958 ntAPPRIS ALT2 TSL 510.3□□□□□ -0.763e-9■■■■■ 44.6
EFTUD2Q15029 EMG1-201ENST00000539196 616 ntTSL 26.47□□□□□ -1.373e-9■■■■■ 44.6
EFTUD2Q15029 UHRF1-202ENST00000613817 1859 ntTSL 221.71■■□□□ 1.071e-6■■■■■ 44.6
EFTUD2Q15029 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.91e-6■■■■■ 44.6
EFTUD2Q15029 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.061e-6■■■■■ 44.6
EFTUD2Q15029 UHRF1-206ENST00000622802 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.371e-6■■■■■ 44.6
EFTUD2Q15029 UHRF1-207ENST00000624301 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.511e-6■■■■■ 44.6
EFTUD2Q15029 UHRF1-205ENST00000620565 3965 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.551e-6■■■■■ 44.6
EFTUD2Q15029 UHRF1-201ENST00000612630 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.631e-6■■■■■ 44.6
EFTUD2Q15029 TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.692e-7■■■■■ 44.6
EFTUD2Q15029 KANSL1-210ENST00000574963 1493 nt13.29□□□□□ -0.286e-17■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.611e-8■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 ELP5-215ENST00000576496 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)18.6■□□□□ 0.571e-8■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 ELP5-211ENST00000573699 864 ntTSL 318.23■□□□□ 0.511e-8■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.411e-8■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 ELP5-213ENST00000574841 510 ntTSL 217.59■□□□□ 0.411e-8■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.371e-8■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.131e-8■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 ELP5-205ENST00000570322 1083 ntTSL 315.66■□□□□ 0.11e-8■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.181e-8■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 ELP5-209ENST00000573513 827 ntTSL 513.9□□□□□ -0.181e-8■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 ELP5-206ENST00000570500 473 ntTSL 213.9□□□□□ -0.181e-8■■■■■ 44.5
EFTUD2Q15029 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.231e-8■■■■■ 44.5
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