Protein–RNA interactions for Protein: Q14D33

RTP5, Receptor-transporting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP5Q14D33 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RTP5Q14D33 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RTP5Q14D33 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms