Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBX1Q14549 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GBX1Q14549 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GBX1Q14549 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GBX1Q14549 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GBX1Q14549 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GBX1Q14549 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBX1Q14549 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBX1Q14549 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GBX1Q14549 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBX1Q14549 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBX1Q14549 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GBX1Q14549 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GBX1Q14549 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GBX1Q14549 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GBX1Q14549 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
GBX1Q14549 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBX1Q14549 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBX1Q14549 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBX1Q14549 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GBX1Q14549 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GBX1Q14549 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GBX1Q14549 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GBX1Q14549 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GBX1Q14549 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GBX1Q14549 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GBX1Q14549 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GBX1Q14549 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GBX1Q14549 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GBX1Q14549 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GBX1Q14549 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GBX1Q14549 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GBX1Q14549 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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GBX1Q14549 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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GBX1Q14549 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBX1Q14549 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GBX1Q14549 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBX1Q14549 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBX1Q14549 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBX1Q14549 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GBX1Q14549 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GBX1Q14549 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBX1Q14549 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GBX1Q14549 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBX1Q14549 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBX1Q14549 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GBX1Q14549 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GBX1Q14549 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBX1Q14549 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBX1Q14549 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBX1Q14549 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBX1Q14549 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
GBX1Q14549 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GBX1Q14549 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GBX1Q14549 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBX1Q14549 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBX1Q14549 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GBX1Q14549 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GBX1Q14549 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBX1Q14549 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GBX1Q14549 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
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