Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BECN1Q14457 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
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