Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

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Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SPIDRQ14159 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPIDRQ14159 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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